求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,

来源：学生作业帮助网编辑：作业帮时间：2024/05/05 21:04:57

求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,
求助保守序列查找,引物设计
最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,

求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,
如果：你研究的物种没有这个基因,就可以按下面步骤做.
1：把你的基因名称粘贴在NCBI的蛋白质数据库中,进行搜索（这个比核酸数据库更保守一些）
2：根据搜索到的结果,看下面列出的信息,有没有和你研究物种是近缘的（从分类上说的）
3：下载10-20条左右的氨基酸序列（片段长度最好差不多、下载最好分布多个近缘物种）
4：保存成FASTA格式,用MEGA软件（或其他可对比软件）,进行比对
5：根据比对结果,找到保守序列（例如MEGA的显示是小星号,这个自己看一下软件就OK啦）
6：根据保守序列,按照简并引物设计原则,设计成对引物.（这个要学习一下如何从氨基酸翻译成核苷酸）
7：将序列给公司,进行合成.
8：回来,进行普通PCR扩增,如果有目的条带,则进行割胶回收,连接载体,克隆,测序
9：将测序结果进行BLASTX比对,看扩增的是否是你的基因,可用于全长扩增等后续实验
如果：你研究的物种有这个基因,就直接根据数据库中的序列设计引物就行啦.

求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导, 特异引物PCR问题各位大牛,小弟初涉分子生物实验,最近在用设计好的特异性引物扩增保守序列,可是总也是扩增不出来,常常是只有引物二聚体,没有任何扩增条带,我也试着在引物报告单上所给设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长如何读基因序列,设计引物时的保守区指那一段序列 PCR引物设计中的问题、保守序列在目的基因内、但是引物为什么在保守序列设计?设计引物为什么一定要在保守序列内设计?保守序列在ORF内,在保守序列内设计引物怎么得到能够完整表达的核试根据一段序列设计一对pcr引物,并在两端加上两个限制性酶切位点这是老师给的考试题库，题目就是这个了。若给一指定DNA序列并需要通过PCR扩增此序列,如何设计扩增引物? 怎么查找猪P66Shc基因序列?最好有过程和结果,（pcr引物设计用）设计引物如何选择序列加拿大哥伦比亚大学设计并公布的ISSR引物序列,能不能给我一份儿啊!谢谢! toutou1986@163.com 怎样查找基因序列RS号我要做基因多态性,知道SNP位点,设计引物需要序列RS号,请问怎样去查找 GKVVLIVNLAT DIRWNFEKFLI是我经蛋白质比对后选取的两个保守序列怎么进行简并引物的设计全序列为malhedkriplseysgkvvlivnlatyglnfqyhelnvlqetfpedfvitgfpcnqfalqepaangtelidglmhvrpgngfepnfrlfgkvevngenetplysylkescpstmdefmrsemlhya 怎样在genebank查找16SrDNA序列我想设计16SrDNA的引物,但是找不到16SrDNA的序列,genebank中都是16SrRNA的序列,我是新手, 关于引物设计要对目的基因进行定量分析,基因全长1932NT,是不是只要选择其中的一段就行了,长约400NT左右,那么这一段应如何选?该基因的保守序列吗?该怎么确定一段基因是否是保守序列?我在G 引物设计区域选择问题.我设计兼并引物.多序列比对发现三个保守区.一个在中上游,一个在中游,一个在下游.有经验的朋友能告诉我我该选哪个保守区设计引物吗?设计多少对比较好?用来扩增给出dna序列怎么设计引物如何设计已知序列的引物 RT-PCR的引物如何设计?本人刚接触RT-PCR,需要从其它几个物种基因的保守序列中,设计出另一个物种这个基因RT-PCR引物,但是实在是一头雾水,