作业帮已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/10 19:44:19
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
首先请上NCBI BLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.
若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物.比如你的蛋白质N端序列为
MTAGSR...
上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额)
下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3'
则下引物为 5'-NTC NTC-3'
不好意思!不是非常了解，不作答。
若搜索不到任何信息，就需要通过设计兼并引物。比如你的蛋白质N端序列为 常规PCR反应用于已知DNA序列的扩增，反应循环数为25 35，变性温度为94℃，复
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端如果N端序列为TNTPE请问下上游引物应为ACN AAY ACN CCN GAR 还是TGNTTRTGNGGNCTY?
各位高手请问一下Burkholderia菌是属于细菌,我可以用3'RACE方法扩增其全基因序列吗?引物怎么设计谢谢你的回答,不过我现在做的是Burkholderia产的脂肪酶的全基因扩增,通过酶的分离纯化后得到N
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