请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/11 15:15:44
请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST

请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST
请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST

请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST
去除载体等冗余序列用NCBI的vecscreen功能:

测序结果里一般没有引物序列的

因为Sanger测序的自动化应用限制,测序结果中是不可能出现引物序列的。只可能出现部分载体序列。但是如果使用的载体所推荐的测序引物,那测序结果中的载体序列一般不会太长,一般不影响BLAST结果。当然要是插入序列太短则可能在3‘端出现载体序列,与载体序列比对后直接手动删掉就好。 楼上说的vecscreen也确实还好用。...

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因为Sanger测序的自动化应用限制,测序结果中是不可能出现引物序列的。只可能出现部分载体序列。但是如果使用的载体所推荐的测序引物,那测序结果中的载体序列一般不会太长,一般不影响BLAST结果。当然要是插入序列太短则可能在3‘端出现载体序列,与载体序列比对后直接手动删掉就好。 楼上说的vecscreen也确实还好用。

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请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST 请问拿到测序的结果,怎么找不到引物序列? 请问拿到测序的结果,怎么找不到引物序列? 克隆测序结果找不到目的片段的引物序列 如何将氨基酸序列转化为核苷酸序列我想根据氨基酸测序结果设计引物扩增编码序列 同样序列,测序之后,发现不同我PCR出一个条带,胶回收后拿去测序,一共测了两次,结果都发现找不到引物,然后用这两次测序结果进行对比,发现根本不是同一个序列.我想请问一下,这是因为我克 TA克隆正反向测序结果都找不到扩增目的条带的引物(载体通用引物也找不到)TA克隆正反向测序结果都找不到扩增目的条带的引物(载体通用引物也找不到,互补序列都试了),请问这是空载 请问您一个基因的全长已经克隆出来,怎样进行验证呢?从ATG和TGA设引物重新扩增,还是从非编区设引物呢我已经从ATG和TGA设引物了,挑了四五个单克隆,可是每个测序结果都有几个碱基突变, 序列比对 测序结果回来了 怎么进行序列比对,用什么软件 我做的是双向测序,片段300bp左右.请问怎么在测序结果中找出引物?需不需要把某个片段或序列变方向之类的 关于oligo引物设计这个软件是导入mRNA序列还是cDNA序列进行引物设计呢? 请问用SPSS进行回归分析时,怎么剔除相关性小的自变量?得出的结果看不懂啊 测序以后拿回来的DNA序列,怎么判断它的里面有没有引物序列?如果有的话怎么切除引物序列? 引物测序结果怎么看 如何用blast检测引物序列结果好不好 怎样查找基因序列RS号我要做基因多态性,知道SNP位点,设计引物需要序列RS号,请问怎样去查找 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内 有没有人反向PCR以后,连到载体上,测序发现:只有引物正确,其它的都不是目的序列就是说反向PCR后,扩增出来的序列本应该是有酶切位点的,结果测序结果显示没有那个酶切位点,但是却有引物